1、选择水培石斛兰苗：水培之前，首先要选择适合水培的植株，以生长2年以上并且已经驯化的石斛兰幼苗最佳，或剪掉老植株上的部分枝条和花苞也可以。
2、处理水培植株 ：将选择好的植株仔细清洗一下，将其上面的泥土洗掉，并剪去上面的烂根、老根或病根，之后就可将它泡在放有多菌灵的溶液中，以防根部伤口受到病菌感染，消毒好之后，就可将它放在阴凉地方晾干，就可进行水培了。
3、准备水培容器：选择水培容器时，最好用透明度较好的瓶子，并且瓶子上面还带颈，因为这样就可以让铁皮石斛完全融入到水中，如果找不到这种瓶子的话，可以用胶带将其固定住。
4、进行水培：将准备好的水培植株放在瓶子里面，然后就可以向里面开始添加水分，水里可适当添加一些植物营养液，通常用氨基酸或者酵素，苹果醋也可以，但不管是哪一种，都不可放太多，只需一小瓶盖即可。如果你不想用这些，也可以直接买营养液。
5、及时换水和营养液：水培时，要注意定时给它换水和营养液，如果是春天，时间以7到10天最好，如果是冬天就可相隔时间长一些，因为此时温度低，植物消耗的营养少，以15天左右换一次最佳。到了夏天时，它的呼吸量大，营养消耗也快，所以相隔4到5天就需换一次营养液和水，这样才能将其水培好。